Organisation des équipes et de la collecte à fort dauphin (expédition atimo vatae à madagascar)

Objectifs :
Cette fiche présente à l’aide d’une iconographie commentée l’organisation des équipes scientifiques, la collecte des échantillons et leur traitement, pour les 3 semaines de mission basées à Fort Dauphin (du 27 avril au 17 mai 2010).

Contexte :
L’expédition Atimo Vatae (qui signifie en malgache « grand sud ») commence par un premier module de 3 semaines, basé à Fort Dauphin. Les membres de la mission sont installés dans un hôtel de la presqu’île de Taolagnaro (Fort Dauphin en malgache). Gîte, repas et laboratoire sont ainsi concentrés sur le même site. La collecte des échantillons marins a lieu dans un rayon de 10 minutes à 1 heure et demi autour de l’hôtel.

La collecte est répartie entre plusieurs équipes et fait appel à différentes techniques. Une répartition précise des tâches entre les différents membres de la mission est nécessaire pour rassembler un maximum d’échantillons et assurer leur traitement rapide et leur conditionnement, en vue du transport vers Paris où ils seront déterminés (pour les espèces connues) ou décrits et nommés (pour les espèces nouvelles).

Documents :

Document 1 : les équipes et la collecte

Quatre équipes sont chargées de collecter les spécimens chaque jour :

• Une première équipe, dirigée par Rudo von Cosel, effectue des collectes à l’aide d’une drague triangulaire et d’un chalut à perche (entre 1 et 40 mètres de profondeur), à bord du Patsa, un petit bateau de 7 m.

• Des plongés avec engins (suceuse et brossage) seront menées à partir d’un bateau semi-rigide de 6m, par Laurent Albenga, Patrice Petit-Devoize et Pascal Bigot

• Des plongées sans engins seront effectuées à partir d’un second bateau semi-rigide. Elles permettront des récoltes « à vue », c'est-à-dire basées sur un repérage à l’œil et une collecte à la main. C’est aussi l’occasion de prendre des photos sous marines des échantillons. Cette équipe est donc dirigée par Pierre Laboute, spécialiste de la photo sous marine.

• Enfin une équipe sera chargée de la récolte à marée basse, dans la zone intertidale. Dirigés par Pierre Lozouet, les membres de l’équipe collecteront les échantillons à la main ou utiliseront différents outils (drague à main pour les mollusques, piolet pour les algues encroûtantes par exemple…).

Les différents outils utilisés pour la récolte et cités ici feront l’objet d’une autre fiche.

La collecte concerne essentiellement les mollusques, crustacés et algues (la plupart des scientifiques de cette mission s’intéressent en effet à ces groupes) et plus ponctuellement les échinodermes.

En outre 2 chercheurs, Phil et Elaine Heemstra, se concentreront sur les poissons. Ainsi il ne sera pas rare que certains membres de l’expédition rendent visite à des pêcheurs malgaches pour leur acheter des échantillons, tels que des langoustes et des poissons !

Document 2 : le traitement des échantillons et le laboratoire

Une aire de tamisage (permettant de séparer les différentes fractions collectées selon leur taille) est installée à proximité de la plage, en contrebas de l’hôtel.
Les échantillons sont ensuite traités dans le laboratoire, lui-même installé dans l’hôtel. Ici les espaces sont en général voués à une fonction précise :

• à l’extérieur : tri des échantillons

• à l’intérieur plusieurs postes : photographie des spécimens, prélèvement en vue des analyses moléculaires, observation des échantillons à la loupe binoculaire.

Si un réfrigérateur et un congélateur sont disponibles sur place, il n’y a cependant pas de chaîne de froid possible par la suite, les échantillons doivent donc tous être conditionnés en vue de leur transport (alcool pour les mollusques, herbier pour les algues…).

Document 3 : étiquetage et compte rendus des travaux

Le nombre d’échantillons rapportés chaque jour peut vite devenir important (par exemple lors de la première journée de collecte, les algologues ont enregistré environ 50 échantillons…). Une méthode d’étiquetage des échantillons, rigoureuse et commune à tous, est donc nécessaire. Sur chaque échantillon est apposée une étiquette comprenant :

• un code constitué de la lettre T (pour Taolagnaro) suivie d’une seconde lettre précisant le type de récolte utilisé (S pour Suceuse, B pour Brossage, R pour Récolte à vue, M pour Marée basse…) et enfin d’un numéro (commençant à 1 et pouvant aller aussi loin que souhaité selon le nombre d’échantillons collectés pendant la mission)

• le nom du site de la collecte

• la date

En outre, une personne est chargée de rassembler chaque jour, auprès de chaque équipe, une courte description du site de collecte et des types d’outils utilisés. Ces informations sont rassemblées dans un « cahier de stations » qui permettra ultérieurement, en cas de besoin, de reconstruire l’histoire d’un échantillon.